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转录需要解旋酶吗?-引自内质网平台  

2012-11-28 17:02:29|  分类: 默认分类 |  标签: |举报 |字号 订阅

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主题:转录时需要解旋酶吗?
1
转录需要解旋酶吗?-引自内质网平台 - 顺反子 - 顺反子
转录时需要解旋酶吗?RNA聚合酶具有解旋的功能,是不是说整个转录过程中就没有解旋酶参与了呢?转录结束时,将RNA释放出来时氢鍵是如何断开的呢?
2008-4-27 18:19 回复此发言
2
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身份:圈友
发帖:363
转录时需要解旋酶
2008-4-27 22:24 回复此发言
3
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身份:圈友
发帖:562
转录时不需要解旋酶!
2008-4-30 08:48 回复此发言
4
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身份:管理员
发帖:219
转摘: 
by:水一滴  
必修2教师用书99页右上角:基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域,叫做启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特异性结合的位点,决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后,在特定区域将DNA双螺旋两条链之间的氢键断开,使DNA解旋,形成单链区,以非编码链为模板合成RNA互补链的过程就开始了。 
 
不过分子生物学中在讲到这个问题时,应该是转录的延伸还是需要解旋酶的。转录泡维持延伸时,在RNA聚合酶下游的DNA需不断解链,可使其下游的DNA(未解开双链部分)越缠越紧,形成正超螺旋,而其上游DNA变得松驰,产生负超螺旋,需要解旋酶和拓扑异构酶来消除这些现象。 
 
谁是谁非,问题出在哪里? 
 
原来,在真核细胞中,RNA聚合酶通常不能单独发挥转录作用,而需要与其他转录因子共同协作,有些辅助功能的转录因子就是解旋酶! 
2008-4-30 08:58 回复此发言
5
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黑鱼:
转摘: 
by:水一滴  
必修2教师用书99页右上角:基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域,叫做启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特异性结合的位点,决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后,在特定区域将DNA双螺旋两条链之间的氢键断开,使DNA解旋,形成单链区,以非编码链为模板合成RNA互补链的过程就开始了。 
 
不过分子生物学中在讲到这个问题时,应该是转录的延伸还是需要解旋酶的。转录泡维持延伸时,在RNA聚合酶下游的DNA需不断解链,可使其下游的DNA(未解开双链部分)越缠越紧,形成正超螺旋,而其上游DNA变得松驰,产生负超螺旋,需要解旋酶和拓扑异构酶来消除这些现象。 
 
谁是谁非,问题出在哪里? 
 
原来,在真核细胞中,RNA聚合酶通常不能单独发挥转录作用,而需要与其他转录因子共同协作,有些辅助功能的转录因子就是解旋酶! 

转录 (transcription)是以DNA单链为模板,NTP为原料,在DNA依赖的RNA聚合酶催化下合成RNA链的过程。 
转录的模板是单链DNA,与复制的模板有较多的不同特点,引出了下列相关概念。 
转录过程只以基因组DNA中编码RNA(mRNA、tRNA、rRNA及小RNA)的区段为模板。把DNA分子中能转录出RNA的区段,称为结构基因。结构基因的双链中,仅有一股链作为模板转录成RNA,称为模板链,与模板链相对应的互补链,其编码区的碱基序列与mRNA的密码序列相同(仅T、U互换),不同基因的模板链与编码链。
2008-4-30 23:27 回复此发言
6
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发帖:256
既然有其中一条链来转录,那么必须把双螺旋结构打开。 
在解开双螺旋结构时候就需要界旋酶吧。
2008-4-30 23:53 回复此发言
7
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发帖:562
拓扑异构酶是与解链有关的酶,而不是解旋酶! 
  
与解链有关的酶和蛋白质包括: 
1.单链结合蛋白 
2.解旋酶 
3.拓扑异构酶Ⅰ   
4.拓扑异构酶Ⅱ 
 
RNA聚合酶本身可以诱导Pribnow box 到 open-promoter complex的构像变化,RNA聚合酶可以解旋. 
 
http://etc.lyac.edu.cn/courseware/01_02fenzishengwuxue/class/book/book3_03_01.htm
2008-5-02 12:24 回复此发言
8
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身份:圈友
发帖:562
有些辅助功能的转录因子不是解旋酶,如TFⅡA. 
 
解旋酶是一类能通过水解ATP获得能量来解开DNA的酶. 
2008-5-02 12:32 回复此发言
9
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发帖:734
解旋酶:解开DNA双螺旋,用于DNA复制和RNA转录中。
2008-5-04 18:21 回复此发言
10
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身份:圈友
发帖:562
再查了资料,原来有2种转录因子是解旋酶:TFⅡ-F、TFⅡ-H。 
原来对[教师用书]的认识是错的。 
(必修2教师用书99页右上角:基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域,叫做启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特异性结合的位点,决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后,在特定区域将DNA双螺旋两条链之间的氢键断开,使DNA解旋,形成单链区,以非编码链为模板合成RNA互补链的过程就开始了。 ) 
  
 
 
 
反式作用因子(transacting factors) 
 
  以反式作用影响转录的因子可统称为转录因子(transcription factors, TF)。RNA聚合酶是一种反式作用于转录的蛋白因子。在真核细胞中RNA聚合酶通常不能单独发挥转录作用,而需要与其他转录因子共同协作。与RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ相应的转录因子分别称为TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ,对TFⅡ研究最多。表19-2列出真核基因转录需要基本的TFⅡ。 
 
表19-2 RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子 
 
转录因子    分子量(kD)            功能  
TBP         30                      与TATA盒结合  
TFⅡ-B      33                    介导RNA聚合酶Ⅱ的结合  
TFⅡ-F      30,74                  解旋酶  
TFⅡ-E      34,37                 ATP酶  
TFⅡ-H      62,89                  解旋酶  
TFⅡ-A      12,19,35              稳定TFⅡ-D的结合  
TFⅡ-I      120                   促进TFⅡ-D的结合  
 
  以前认为与TATA盒结合的蛋白因子是TFⅡ-D,后来发现TFⅡ-D实际包括两类成分:与TATA盒结合的蛋白是TBP(TATAbox binding protein),是唯一能识别TATA盒并与其结合的转录因子,是三种RNA聚合酶转录时都需要的;其他称为TBP相关因子(TBPassociated factors TAF),至少包括8种能与TBP紧密结合的因子。转录前先是TFⅡ-D与TATA盒结合;继而TFⅡ-B以其C端与TBP-DNA复合体结合,其N端则能与RNA聚合酶Ⅱ亲和结合,接着由两个亚基组成的TFⅡ-F加入装配,TFⅡ-F能与RNA聚合酶形成复合体,还具有依赖于ATP供给能量的DNA解旋酶活性,能解开前方的DNA双螺旋,在转录链延伸中起作用。这样,启动子序列就与TFⅡ-D、B、F及RNA聚合酶Ⅱ结合形成一个“最低限度”能有转录功能基础的转录前起始复合物(preintitiation complex, PIC),能转录mRNA。TFⅡ-H是多亚基蛋白复合体,具有依赖于ATP供给能量的DNA解旋酶活性,在转录链延伸中发挥作用;TFⅡ-E是两个亚基组成的四聚体,不直接与DNA结合而可能是与TFⅡ-B联系,能提高ATP酶的活性;TFⅡ-E和TFⅡ-H的加入就形成完整的转录复合体(图19?5),能转录延伸生成长链RNA,TFⅡ-A能稳定TFⅡ-D与TATA盒的结合,提高转录效率,但不是转录复合体一定需要的。 
 
2008-5-04 21:35 回复此发言
11
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学习了
2008-5-06 00:37 回复此发言
12
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发帖:1828
很佩服各位的钻研精神,学习了。
2008-5-06 14:48 回复此发言
13
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感谢各位了!
2008-5-09 20:12 回复此发言
14
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发帖:28
很佩服各位的钻研精神,学习了。
2008-5-22 20:59 回复此发言
15
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发帖:734
需要的. 
 转录是生物合成RNA的过程,与复制相似,有起始、核苷酸链延长和链合成终止三个阶段。 
转录延长阶段发生的反应,在原核生物和真核生物比较相近。在转录延长过程中,DNA双链需解开10~20 bp,形成的局部单链区象一个小泡,故形象地称为转录泡。转录泡是指RNA聚合酶-DNA模板-转录产物RNA结合在一起形成的转录复合物。为了保持局部的转录泡状态,在RNA聚合酶下游的DNA需不断解链,可使其下游的DNA(未解开双链部分)越缠越紧,形成正超螺旋,而其上游DNA变得松驰,产生负超螺旋,需要解旋酶和拓扑异构酶来消除这些现象。 
2008-5-24 16:27 回复此发言
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发帖:175
《分子遗传学》1992年4月第一版、周希澄等合编。P115页 
RNA聚合酶识别DNA的启动区并与之结合,形成的酶-DNA复合体叫做“闭合复合体”或“封闭式复合体”,因为这时的DNA仍以双螺旋形式存在。 
通过打开几个碱基对(双链DNA局部打开成单链),使酶得以和碱基接触,从而形成“开放式复合体”,这种结合叫紧密结合。 
已知酶结合的启动区部位常常是A/T高含量区段。该区段熔点低,双链容易打开。 
2008-5-25 22:01 回复此发言
17
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发帖:175
酶是一系列复合体,在生物体内起作用的往往是酶系,不是一个酶在单独起作用。 
总上可以看出:RAN聚合酶不是一种,在进行转录时候有一个复杂的调控体系。高中教材应该是进行了简化处理,所以这里可以不考虑此类问题。学生只要知道有RNA聚合酶这个名称就可以。
2008-5-26 10:16 回复此发言
18
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已下载
2008-12-09 07:14 回复此发言
19
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发帖:223
一江秋水:
再查了资料,原来有2种转录因子是解旋酶:TFⅡ-F、TFⅡ-H。 
原来对[教师用书]的认识是错的。 
(必修2教师用书99页右上角:基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域,叫做启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特异性结合的位点,决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后,在特定区域将DNA双螺旋两条链之间的氢键断开,使DNA解旋,形成单链区,以非编码链为模板合成RNA互补链的过程就开始了。 ) 
  
 
 
 
反式作用因子(transacting factors) 
 
  以反式作用影响转录的因子可统称为转录因子(transcription factors, TF)。RNA聚合酶是一种反式作用于转录的蛋白因子。在真核细胞中RNA聚合酶通常不能单独发挥转录作用,而需要与其他转录因子共同协作。与RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ相应的转录因子分别称为TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ,对TFⅡ研究最多。表19-2列出真核基因转录需要基本的TFⅡ。 
 
表19-2 RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子 
 
转录因子    分子量(kD)            功能  
TBP         30                      与TATA盒结合  
TFⅡ-B      33                    介导RNA聚合酶Ⅱ的结合  
TFⅡ-F      30,74                  解旋酶  
TFⅡ-E      34,37                 ATP酶  
TFⅡ-H      62,89                  解旋酶  
TFⅡ-A      12,19,35              稳定TFⅡ-D的结合  
TFⅡ-I      120                   促进TFⅡ-D的结合  
 
  以前认为与TATA盒结合的蛋白因子是TFⅡ-D,后来发现TFⅡ-D实际包括两类成分:与TATA盒结合的蛋白是TBP(TATAbox binding protein),是唯一能识别TATA盒并与其结合的转录因子,是三种RNA聚合酶转录时都需要的;其他称为TBP相关因子(TBPassociated factors TAF),至少包括8种能与TBP紧密结合的因子。转录前先是TFⅡ-D与TATA盒结合;继而TFⅡ-B以其C端与TBP-DNA复合体结合,其N端则能与RNA聚合酶Ⅱ亲和结合,接着由两个亚基组成的TFⅡ-F加入装配,TFⅡ-F能与RNA聚合酶形成复合体,还具有依赖于ATP供给能量的DNA解旋酶活性,能解开前方的DNA双螺旋,在转录链延伸中起作用。这样,启动子序列就与TFⅡ-D、B、F及RNA聚合酶Ⅱ结合形成一个“最低限度”能有转录功能基础的转录前起始复合物(preintitiation complex, PIC),能转录mRNA。TFⅡ-H是多亚基蛋白复合体,具有依赖于ATP供给能量的DNA解旋酶活性,在转录链延伸中发挥作用;TFⅡ-E是两个亚基组成的四聚体,不直接与DNA结合而可能是与TFⅡ-B联系,能提高ATP酶的活性;TFⅡ-E和TFⅡ-H的加入就形成完整的转录复合体(图19?5),能转录延伸生成长链RNA,TFⅡ-A能稳定TFⅡ-D与TATA盒的结合,提高转录效率,但不是转录复合体一定需要的。 
 

支持
2011-11-22 08:44 回复此发言
20
转录需要解旋酶吗?-引自内质网平台 - 顺反子 - 顺反子
身份:圈友
发帖:116
不好意思,因为群里对转录是否需要解旋酶有点争论,把这个老帖子翻出来,让原来没有参与讨论的老师看看,大家不要怪。我也觉得,我们要时常把原来讨论过已得出结论的帖子拿出来翻翻,使新进入圈子的老师了解一下这些好的观点。
2012-11-28 16:56 删除 回复此发言
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